Christopher Corbeil

Rôles et responsabilités

 Dr Corbeil est actuellement agent de recherche au groupe de modélisation moléculaire et se spécialise dans le développement et l'application d'outils computationnels pour la conception de protéines thérapeutiques. Il est également membre affilié du département de biochimie de l'Université McGill. Après avoir obtenu son doctorat de l'Université McGill, il s'est joint au CNRC en tant qu'associé de recherche pour étudier la physique de l'interaction des protéines avec les produits thérapeutiques. Après son séjour au CNRC, il a rejoint le Chemical Computing Group en tant que chercheur scientifique développant des outils pour l'ingénierie des protéines, la prédiction de la structure et l'affinité de liaison. Il a ensuite décidé de quitter le secteur privé et de revenir au CNRC en se concentrant sur l'ingénierie des anticorps.

Recherche et / ou projets en cours

Dr Corbeil joue un rôle clé dans le développement par ordinateur des anticorps thérapeutiques à HHT. À ce titre, il dirige et soutient des projets internes et externes. Il dirige actuellement les travaux visant à intégrer les méthodes ML/AI pour la conception, l'optimisation et la fabrication d'anticorps tout en répondant aux besoins de HHT en matière de structure des protéines.

Études

  • 2009 : Doctorat en chimie, Université McGill, superviseur : Nicolas Moitessier.
  • 2004 : B.Sc.(Hons.) en chimie, Université Saint Mary's, Superviseur, Dr. Corey Pye

Activités professionnelles / intérêts

02/2021-aujourd'hui : Comité du bien-être du CNRC-HHT, CNRC-HHT
02/2010-06/2013 : Président, Comité de conception de médicaments assistée par ordinateur de Montréal
07/2011-03/2012 : Coprésident, CADD : Hopes Reality and Prospects, ACS San Diego (en anglais seulement)
09/2006-08/2007 : Coprésident, Série de conférences invitées par les étudiants en chimie de McGill, Université McGill
10/2005-11/2005 : Conception du site Web et du résumé, 16e QOMSBOC, Université McGill
06/2005-05/2006 : Président, Société des étudiants diplômés en chimie de McGill, Université McGill
06/2002-06/2004 : Président, 2004 Atlantic Student Chemistry Conference, Université Saint Mary's
05/2001-04/2004 : Président, Société de chimie de l'Université Saint Mary's, Université Saint Mary's.

Affiliations académiques :

09/2021-aujourd'hui : Membre affilié, Département de biochimie, Université McGill

Instructeur/conférencier :

06/2022-05/2022 : Instructeur, Introduction à l'apprentissage automatique pour la conception de produits biologiques
Cambridge Healthtech Institute, USA , (15-30 étudiants/an)
09/2020-aujourd'hui : Chargé de cours BTEC650, Université McGill (10 étudiants/an)
01/2016-aujourd'hui : Chargé de cours BIOC605, Université McGill (10 étudiants/an)
09/2015-aujourd'hui : Chargé de cours PHAR505, Université McGill (70-90 étudiants/an)
05/2017-05/2022 : Instructeur, Introduction à la conception et au développement de médicaments basés sur la structure.
Cambridge Healthtech Institute, USA, (15-30 étudiants/an)
09/2017-11/2017 : Instructeur, Introduction à la conception et au développement de médicaments basés sur la structure,
HHT-CNRC, (30-40 étudiants)

Principales publications

33 Total ; 32 publié ; 1 soumis ; 11 auteur principal

  1. *** Gaudreault, F., Corbeil, C. R. & Sulea, T. Enhanced antibody-antigen structure prediction from molecular docking using AlphaFold2. BioRxiv 2022.12.26.521961 (2022). doi:10.1101/2022.12.26.521961 soumis à Sci Rep

    Ce travail est le premier exemple de la façon dont AlphaFold2 pourrait être appliqué avec succès au domaine de la prédiction du complexe anticorps:antigène [MM1] . Ce travail démontre clairement que l'apprentissage profond peut réussir à identifier de bons complexes anticorps:antigène. Cela nous permettra de nous intégrer aux méthodes expérimentales où les informations 3D de l'anticorps s'avèrent utiles, comme l'ingénierie des anticorps et la cartographie des épitopes.
  2. *** Corbeil, C. R., Manenda, M. S., Sulea, T., Baardsnes, J., Picard, M.-È., Hogues, H., Gaudreault, F., Deprez, C., Shi, R. & Purisima, E. O. Redesigning an antibody H3 loop by virtual screening of a small library of human germline-derived sequences. Sci Rep 11, 21362 (2021).

    Ce travail a été le point culminant de la prochaine génération d'ADAPT, incorporant la capacité de varier les séquences CDRH3 tout en étant le premier exemple d'utilisation de séquences H3 naïves pour la conception computationnelle d'anticorps [MM2] . Ce travail améliore encore la plateforme ADAPT et nous permet d'accéder à des brevets en réorganisant les CDR-H3 d'anticorps connus.
  3. Sulea, T., Rohani, N., Baardsnes, J., Corbeil, C. R., Deprez, C., Cepero-Donates, Y., Robert, A., Schrag, J. D., Parat, M., Duchesne, M., Jaramillo, M. L., Purisima, E. O. & Zwaagstra, J. C. Structure-based engineering of pH-dependent antibody binding for selective targeting of solid-tumor microenvironment. MAbs 12, 1682866 (2020).
  4. Hogues, H., Gaudreault, F., Corbeil, C. R., Deprez, C., Sulea, T. & Purisima, E. O. ProPOSE : Direct exhaustive protein-protein docking with side chain flexibility. J Chem Theory Comput 14, 4938--4947 (2018).
  5. Vivcharuk, V., Baardsnes, J., Deprez, C., Sulea, T., Jaramillo, M., Corbeil, C. R., Mullick, A., Magoon, J., Marcil, A., Durocher, Y., Connor-McCourt, M. D. O. & Purisima, E. O. Assisted Design of Antibody and Protein Therapeutics (ADAPT). Plos One 12, e0181490 (2017). [35]
  6. Sulea, T., Vivcharuk, V., Corbeil, C. R., Deprez, C. & Purisima, E. O. Assessment of Solvated Interaction Energy Function for Ranking Antibody-Antigen Binding Affinities. J Chem Inf Model 56, 1292--1303 (2016).
  7. *** Corbeil, C. R., Williams, C. I. & Labute, P. Variabilité des taux de réussite de l'amarrage due à la préparation des ensembles de données. J Comput Aid Mol Des 26, 775--86 (2012).

    Il s'agit de la publication de la fonction de notation GBVI/WSA qui a été utilisée par de nombreuses sociétés pharmaceutiques pour la conception et l'identification de nouveaux médicaments à petites molécules.
  8. Corbeil, C. R., Thielges, S., Schwartzentruber, J. a J. A. & Moitessier, N. Toward a computational tool predicting the stereochemical outcome of asymmetric reactions : development and application of a rapid and accurate program based on organic principles. Angewandte Chemie Int Ed 47, 2635--8 (2008).
  9. Moitessier, N., Englebienne, P., Lee, D., Lawandi, J. & Corbeil, C. R. Towards the development of universal, fast and highly accurate docking/scoring methods : a long way to go. Brit J Pharmacol 153 Suppl, S7--26 (2008). [645]
  10. *** Corbeil, C. R., Englebienne, P. & Moitessier, N. Docking ligands into flexible and solvated macromolecules. 1. Développement et validation de FITTED 1.0. J Chem Inf Model 47, 435--49 (2007).

    Ce seul article est au cœur de la plateforme Molecular Forecaster qui a conduit à une start-up canadienne (Molecular Forecaster, https://molecularforecaster.com/) et la base de toutes les recherches qui ont suivi au sein du groupe de recherche Moitessier à l'Université McGill.

Expérience de travail antérieure

08/2014-aujourd'hui : Agent de recherche associé, HHT-CNRC (Royalmount)
09/2010-08/2014 : Chercheur scientifique, Chemical Computing Group, Montréal, Canada
01/2009-09/2010 : Associé de recherche, IRB-CNRC
09/2004-04/2004 : Assistant d'enseignement, Université McGill (Chimie), Montréal Canada
09/2000-08/2004 : Assistant de recherche, Université Saint Mary's (Chimie), Halifax, Canada

Christopher Corbeil

Christopher Corbeil

Agent(e) de recherches senior
Thérapeutique en santé humaine
6100, avenue Royalmount
Montreal, Quebec H4P 2R2
Langue préférée : anglais
Téléphone : 438-465-3890

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Sciences, Recherche scientifique